國內首創，開發並公開可透過特性資訊搜尋微生物種類的整合資料庫

　作為NEDO委託事業「加速實現碳循環的生物來源產品生產技術開發」（以下簡稱本事業）的一部分，獨立行政法人產品評價技術基盤機構（NITE）近日開發並啟用了「微生物選定支援工具」（以下簡稱本資料庫），這是一個可根據微生物特性資訊，從全球主要資料庫中公開的微生物種類中，橫向搜尋具有特定特性微生物的資料庫。

　本資料庫從公開的五個國際主要資料庫中收錄的約67000筆微生物菌株資訊中，收集了培養溫度、培養pH值、氧氣需求等7種關於微生物的重要特性資訊，並將其按微生物種類進行整理和整合。這是一個能夠透過特性資訊以日文橫向搜尋微生物種類的整合資料庫。這是國內首次開發出可透過特性資訊搜尋微生物種類的整合資料庫。

　以往，研究人員必須在個別資料庫中逐一查看數據來搜尋微生物，但透過本資料庫，在日本試圖建構智慧細胞的研究人員，將能更容易地搜尋具有其感興趣特性的微生物。未來，我們將根據使用者的需求擴充功能。

1．背景

　在生物製造領域，為了解決從原料到最終產品的瓶頸，積極利用人工最大化提高物質生產能力的生物細胞「智慧細胞」的趨勢日益活躍。由於智慧細胞的開發耗時費力，因此在起始階段，有效選定適合所需物質和生產條件的微生物至關重要。然而，以往培養溫度、培養pH值、氧氣需求等特性資訊分散在多個資料庫中，研究人員需要逐一查看個別資料庫的數據來搜尋和選定微生物，這對研究人員來說是一個沉重的負擔。

　在此背景下，NEDO自2020年度起透過本事業※1，致力於擴充用於創建工業智慧細胞的生物資源，並開發其探索的基礎技術。作為其中一環，NEDO正與NITE合作，開發一個能提高微生物探索效率的資料庫。

2．本次成果

（1）微生物選定支援工具的開發

　從NBRC※2線上目錄（收錄約21000筆菌株資訊）、JCM線上目錄（約9000筆）、JGI GOLD（約14000筆）、BV-BRC（約14000筆）、TEMPURA（約9000筆）等多個資料庫中收錄的約67000筆微生物菌株資訊中，收集培養溫度、培養pH值、氧氣需求等7種特性資訊，並按微生物種類進行整理和整合，從而建構了一個支援以日文選定微生物和檢討培養條件的資料庫。這是國內首次※3開發出可透過特性資訊搜尋微生物種類的整合資料庫。

　此外，對於培養溫度和培養pH值，除了以長條圖顯示分佈外，還即時顯示搜尋結果的數量，從而實現更視覺化的探索。

透過利用本資料庫，可以有效地調查具有特定性質（如培養溫度、培養pH值、氧氣需求、嗜鹽性等）的微生物。

（2）微生物選定支援工具的公開

　本次開發的本資料庫已於2026年2月在NITE營運的生物資源數據平台（DBRP）上公開。

・本資料庫　https://www.nite.go.jp/nbrc/dbrp/trait-search/

・生物資源數據平台（DBRP）　https://www.nite.go.jp/nbrc/dbrp/top

3．未來計畫

　透過本資料庫，國內試圖建構智慧細胞的研究人員將能從全球主要資料庫中橫向搜尋具有其感興趣特性的微生物。未來，NEDO和NITE將根據使用者的需求擴充功能。

【註釋】

※1　本事業

事業名稱：加速實現碳循環的生物來源產品生產技術開發

事業期間：2020年度～2026年度

事業概要：加速實現碳循環的生物來源產品生產技術開發

https://www.nedo.go.jp/activities/ZZJP_100170.html

※2　NBRC

NITE Biological Resource Center的縮寫，指NITE營運的生物資源中心（BRC）。

※3　國內首次

截至2026年3月，根據NITE的調查。